Raccolta strettamente senese, allestita dal naturalista Apelle Dei (Siena 1819-1903) presso la propria abitazione, tra il 1862 e il 1887. Lo stesso Dei descrisse la storia della collezione ed espose i motivi che lo avevano spinto ad allestirla. Dopo che egli la ebbe donata all'Accademia, nel 1887, non cessò la propria attività di raccoglitore e di preparatore: molti nuovi reperti, infatti, furono ad opera sua direttamente acquisiti dal museo dei Fisiocritici, fino ad un esemplare di Turdus naumanni eunomus che donò nel 1898, qualche anno prima della morte.