E' curata la manutenzione ordinaria sugli esemplari delle collezioni e sono effettuati interventi straordinari di restauro conservativo.

La Collezione generale di minerali, negli ultimi anni, in vista di una sua catalogazione on-line, è stata oggetto di una accurata revisione classificativa che ha comportato l'esecuzione di circa 200 analisi diffrattometriche.
Le analisi sono state eseguite da Andrea Scala del Gruppo di Ricerca sulla Conservazione del Patrimonio Culturale Lapideo afferente al Dipartimento di Scienze Ambientali dell'Università di Siena.
E' stato utilizzato un diffrattometro a raggi X Bragg-Brentano Philips X'Pert PRO PW 3040, equipaggiato di rilevatore allo stato solido X'Celerator PW 3015.