L'Archivio Storico conserva i documenti manoscritti relativi alla vita e alla storia dell'Accademia dei Fisiocritici e, più in generale, alla storia della scienza senese.
Comprende le seguenti serie: Atti, Verbali, Copialettere, Carteggio, Contabilità, Memorie.
La Soprintendenza Archivistica per la Toscana ne ha notificato la rilevanza culturale.
I documenti del XVIII secolo sono pubblicati nel volume: I documenti dell'Accademia, a cura di Anita Bacci, Donatella Parrini, Francesca Vannozzi, Siena, Accademia dei Fisiocritici, 1994, (Memorie n. 5). Vol. 1: Verbali, Memorie, Epistole ed Atti dalla fondazione al secolo XVIII.
I documenti del secolo XIX sono attualmente in fase di riordino.
Riproduzioni di immagini tratte da materiale archivistico possono essere autorizzate secondo le norme previste da uno specifico Regolamento.